人们相互厮杀，院史争夺有限的资源，地球变成了血腥十足的杀戮死战场。

然而，陈列因为替卢家耀出头，陈列他得罪了狐假虎威心狠手辣的典狱长（张耀扬饰），自此卷入狱中恶势力的漩涡，走投无路之际，他放弃了能忍则忍的处世哲学，决意以暴施暴。钟天正原本有完好家庭，馆隆馆只因嗜赌成性才误杀妻子，身陷囹圄的他追忆往事时后悔不已，决心走出高墙后重新做人

拳村少年张小明，重开是小拳种金刚拳的唯一传承人，重开他肩负着将金刚门发扬光大的重任，只身来到大城市，希冀用传统的武林方式实现光复门派的愿望，怎奈屡屡碰壁，遭人耻笑。正当他心灰意冷时，院史他却邂逅了一位叫李昂的神秘蹉跎青年……《深海巨妖2》承接上一部的精彩剧情，陈列面人爷爷在对抗恶势力的过程中不幸遇难，陈列临终前嘱咐蒋云飞不要再苟且度日迷失自己，势必要帮助大雁战胜幽冥王，结束这样毫无人性的黑暗统治，心系妹妹的王大雁不顾路途凶险执意要前往魔域，蒋云飞为保护大雁一改颓靡不振的状态，最终两人联手冒着生命危险与幽冥王及其手下展开了殊死较量

馆隆馆当他打败独眼龙时。一天，重开龙一从阿飞那里得知他（龙一）价值五百万的字钱被独眼龙给抢走了。

院史龙一知道后赶紧去追讨。

陈列却发现这一切都是阿飞给他设的局。故事描述，馆隆馆明皇身染恶疾，驾崩在即，却无子可继帝位

讲述在日本京都，重开忽然出现一怪客李君强（王羽饰），重开常招惹当地的地痞流氓，他的目的想借此引出黑社会的幕后老板，调查其父亲被迫害的真相，由于他武功高强，被幕后老板清水昭文赏识重用，为取得清水的信任，李不惜用苦肉计，咋了好兄弟刘汉民的饭馆，当刘知道真相后，毅然进入了另一黑帮进行调查，经过调查，他们知道李父是被九指一郎骗去所有产业自杀而死，产业为黑老大山本俊彦（田丰饰）收买，李继续追查院史唐伟成所饰的大反派也非常出彩。

保安队悬赏巨额花红捉拿大盗胡良（唐伟成饰），陈列穷小子皮球（汪禹饰）爱钱又好赌，陈列想拿到这笔花红，先后带灵蛇大侠包扬天（刘家荣饰）、独孤一味叶孤行（徐少强饰）前去与胡良决斗，以图捉到胡良，没想到两位高手全被胡良打死。皮球在好友小梅（黄杏秀饰）的鼓励启发下，馆隆馆勤心苦练，馆隆馆模仿鳝鱼在水中游泳的姿势，练出一套奇异的拳法鳝形拳，又凭借智计和耍球绝技，终于打败胡良，为朋友报了仇。